中藥網絡藥理學研究策略與實用技能(網絡)研討會
時間:2020-11-07 09:00 至 2020-11-08 18:00
地點:北京

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中藥網絡藥理學研究策略與實用技能(網絡)研討會 已截止報名課程時間: 2020-11-07 09:00至 2020-11-08 18:00結束 主辦單位: 醫藥加科研培訓中心
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會議介紹
會議內容 主辦方介紹
中藥網絡藥理學研究策略與實用技能(網絡)研討會宣傳圖
醫藥加ZOOM網絡會議室 2020年11月7-8日
課程背景及簡介:
傳統中藥歷史悠久,在治療復雜慢性疾病方面具有獨到的療效和較小的毒副作用。但中藥存在成分復雜、機制不清的問題,阻礙了中藥的現代化和國際化。中藥的物質基礎和作用機理,尚需應用現代醫學和生物科學技術,進行深入的研究。近年來,將系統生物學的思想和方法應用于中藥研究中,正成為一種新的趨勢。中藥網絡藥理學已發展成為一個新的交叉學科,它將網絡科學、生物信息學、計算機科學和數學等學科的方法結合到中藥藥理的研究中,從分子水平和分子網絡調控的背景中闡明中藥的作用機理。通過中藥網絡藥理學的方法,可望使中藥的理論研究和臨床應用更加科學嚴謹,逐漸得到世界的認可。
中藥網絡藥理學已成為近年來研究的熱點和國家自然基金重點支持的領域,一系列的數據庫及計算方法被開發出來。但是,對于臨床醫生、科研人員和碩博士研究生,尤其是沒有生物信息學分析基礎、不會編寫計算機程序的初學者而言,如何合理地應用這些已有的數據庫和計算方法,分析自己所研究的中藥方劑,解釋實驗結果,仍然是一大難題。
本次培訓班將邀請長期從事中藥網絡藥理學的研究人員,結合個人實踐經驗,帶領廣大學員,從科研設計、項目具體實施以及SCI文章發表等多個方面,通過實際案例,介紹中藥網絡藥理學的研究思路及具體方法。
課程內容、目標與特色:
本次課程以SCI文章為案例主線,逐一詳細剖析,全程電腦實戰教學。理論與實踐相結合,老師將以最簡單易懂的方式,既介紹中藥網絡藥理學的研究路線、發展狀況和最新前沿進展,又介紹具體的數據庫、工具和軟件的使用,并在課堂上進行上機指導。本學習班全部采用免費數據庫和在線分析工具,學員不需要編寫程序。
授課老師:
趙老師,多年從事生物信息學及中藥網絡藥理學方面的研究, 發表生物信息學、網絡藥理學及中藥復方相關SCI數十篇,含多篇5分以上的文章,主持多項國家自然基金和省部級科研課題,獲得多項省部級科研及教學獎項。講課效果好,獲得學員好評。
適合對象:各級醫院臨床醫生、藥師、科研單位研究人員、高校碩/博士研究生、對中藥復方和網絡藥理學感興趣的廣大師生(尤其適合初學者和無基礎的學員,無需任何編程基礎)。時間:2020年11月7-8日
會議地點:醫藥加ZOOM網絡會議室
主辦方:上海循掘生物科技中心
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舉辦了2018腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預測模型構建與基于R語言統計分析學習班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫學Meta分析及網狀Meta三天精講學習班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數據挖掘與分析學習班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標書構思與撰寫學習班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數據挖掘專題學習班2019(1月上海班) 第8期醫學SCI論文寫作及發表技巧學習班2019(1月上海班) ......
會議日程
(最終日程以會議現場為準)
中藥網絡藥理學內容大綱 | |||
日期 | 時間 | 題目 | 課程內容 |
第一天上午 | 9:00-10:45 | 中藥網絡藥理學簡介 | 網絡藥理學的發展歷程和研究現狀簡介 |
中藥網絡藥理學SCI論文的詳細剖析 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | 中藥網絡藥理學簡介 | 中藥網絡藥理學的核心問題 | |
中藥網絡藥理學的研究路線 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第一天下午 | 13:30-14:00 | 中藥有效成分的查找 | 常用中藥數據庫及使用方法 |
14:00-15:30 | 中藥網絡藥理學研究的數據來源 | 化合物結構信息、靶點、ADME信息查詢 | |
用中藥數據庫查詢中藥的成分、靶點 | |||
用藥靶數據庫查詢化合物靶點 | |||
用化合物結構相似性預測化合物靶點 | |||
基于藥效團模型預測化合物靶點 | |||
用分子對接驗證化合物靶點 | |||
15:30-15:45 | 茶歇 | ||
15:45-18:00 | 疾病相關基因的查找及獲得 | 用數據庫查詢疾病相關基因 | |
分析GEO數據庫中的基因芯片數據,獲取疾病相關基因 | |||
18:00-19:30 | 晚餐 | ||
第一天晚上 | 19:30-20:40 | 基于AutoDock Vina軟件分子對接 | 軟件安裝 |
下載小分子配體和蛋白受體的結構文件 | |||
準備配體文件和受體文件 | |||
確定對接區域(對接盒子) | |||
建立配置文件及分子對接 | |||
分子對接結果輸出 | |||
20:40-20:50 | 休息 | ||
20:50-22:00 | 網絡藥理學分析結果的驗證 | 靶標驗證 | |
通路驗證 | |||
藥物效果驗證 | |||
第二天上午 | 9:00-10:45 | 網絡藥理學的實用技能介紹(一) | 基因ID轉換 |
用DAVID進行GO富集、通路富集、tissue富集、疾病基因富集分析;KEGG、Metascape、MetaboAnalyst 通路分析 | |||
用Connectivity Map分析藥物機制 | |||
10:30-10:45 | |||
10:45-12:00 | 基因功能相關網絡構建 | ||
基因共表達網絡構建 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第二天下午 | 13:30-15:30 | 網絡藥理學的實用技能介紹(二) | 全基因組網絡數據獲取 |
Cytoscape軟件構建和分析網絡:網絡構建;基本拓撲特征計算;重要節點識別;網絡拓撲指標含義;模塊分解;子網絡提取;網絡可視化;數據輸入輸出;圖形導出;Cytoscape插件的安裝和使用等 | |||
15:30-15:45 | |||
15:45-16:30 | 藥物影響的子網絡的構建、成分-靶點網絡、成分-靶點-通路網絡構建 | ||
常用圖形繪制方法介紹 | |||
課程總結及文獻分析 | |||
網絡藥理學課題設計、論文撰寫、基金申請介紹 | |||
備注:攜帶電腦,方便跟隨老師進行軟件操作,上課軟件為Cytoscape。 | |||
另需安裝ZOOM網絡會議軟件方可進行網絡會議 |
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會務費用:3200元/人
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1. 提前報名并付款的,可以預先拿到學習資料
2. 三人組團報名,每人優惠100元
3. 四人組團報名,每人優惠200元,
4. 五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊同價值學習班!
5、可額外繳納500元,作為復聽費用(復聽同樣的課程)
可開具正規會務費發票,提供紙質蓋章邀請函
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